NovoNGS ChiTag 2.0 Transposome:上海近岸科技出品。
CUT&Tag是蛋白質(zhì)-DNA互作關(guān)系研究的新方法,相較于傳統(tǒng)的ChIP-Seq具有以下優(yōu)點(diǎn):省時(shí)高效,所需的細(xì)胞量少,背景信號(hào)低,可重復(fù)性好等,甚至可用于單細(xì)胞水平測(cè)序。CUT&Tag是研究體內(nèi)蛋白與染色質(zhì)DNA互相作用的有力工具,對(duì)基因調(diào)控、表觀遺傳等研究具有重大意義。
2.0版ChiTagTM使用pAG-Tn5替換了原先的pA-Tn5,提高了效率,去除了抗體選擇的限制性。
NovoNGS ChiTag 2.0 Transposome:
產(chǎn)品用途:
蛋白質(zhì)-DNA互作研究,可替代ChIP-Seq等方法;特別適用于小樣本和單細(xì)胞的高效表觀基因組分析。 |
產(chǎn)品性能:
本產(chǎn)品是ChiTagTM蛋白與接頭孵育后形成的轉(zhuǎn)座復(fù)合體,轉(zhuǎn)座復(fù)合體可以將基因組DNA打斷成小片段并加上文庫接頭,通過PCR擴(kuò)增,獲得適合Illumina高通量測(cè)序平臺(tái)的測(cè)序文庫。 |
CUT&Tag實(shí)驗(yàn)測(cè)試:
使用80,000個(gè)細(xì)胞進(jìn)行Cut&Tag實(shí)驗(yàn),使用的二抗為山羊抗,PCR擴(kuò)增后效果如下: 下圖顯示,使用pAG-Tn5進(jìn)行CUT&Tag,獲得的文庫產(chǎn)量比pA-Tn5的多,使用pAG-Tn5代替pA-Tn5,可降低實(shí)驗(yàn)對(duì)二抗的要求。 保存溫度: -20℃ 3個(gè)月,長(zhǎng)期保存-80℃。 質(zhì)量保證: 經(jīng)多次柱純化,SDS-PAGE膠檢測(cè)僅可見清晰單一的目的條帶,PCR方法檢測(cè)無宿主DNA殘留,無核酸內(nèi)、外切酶污染。 單鏈接頭序列: Adaptor 1: 5’-TCGTCGGCAGCGTCAGATGTGTATAAGAGACAG-3’ Adaptor 2: 5’-GTCTCGTGGGCTCGGAGATGTGTATAAGAGACAG -3’ ME: 5'-pCTGTCTCTTATACACATCT-3' |